Çocuk Cerrahisi Anabilim Dalı 1992 yılından itibaren çalışmaya başlayan Dr.Hüseyin İLHAN tarafından 2 yılı aşan bir hazırlık döneminden sonra 1995 yılında kurulmuştur.

Anabilim Dalımız 20 yatak kapasitesi ile çalışmaktadır.Yıllık poliklinik sayısı 6800, yatan hasta sayısı 2200 ve ameliyat sayısı 1600 dolayındadır.  
     
Çocuk Cerrahisi Anabilim Dalında Araştırma Görevliliği  süresi 5 yıldır. Araştırma Görevlileri bu süre içinde Yenidoğan, Anesteziyoloji, Genel Cerrahi ve Üroloji rotasyonlarını tamamlamaktadırlar. 
Çocuk Cerrahisi Anabilim Dalı’nda  18 yaşına kadar olan hastalarda toraks, gastrointestinal sistem ve genitoüriner sisteme yönelik  doğumsal ve edinsel cerrahi hastalıkların tedavileri yapılmaktadır.
Anabilim Dalımızda her gün poliklinik hizmeti verilmekte ve haftada 5 gün ameliyathanede cerrahi girişim uygulanmaktadır.
Anabilim Dalında haftada 2 gün Genel Hasta Değerlendirmesi ve haftada bir seminerlerin yapıldığı eğitim toplantıları düzenlenmektedir. Ayrıca Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalına bağlı Nefroloji ve Endokrinoloji Bilim Dalları,  Radyoloji Anabilim Dalı ve Patoloji Anabilim Dalı ile ortak toplantılar düzenlenmektedir.